Utilisation d'une approche de type transcriptome pour l'étude de la formation et de la fonctionnalité de l'appressorium chez le champignon phytopathogène Colletotrichum lindemuthianum

R. Laugé*, C. Veneault* et T. Langin

*: contribution égale au travail. Laboratoire de Phytopathologie moléculaire, Institut de Biotechnologie des Plantes, Bât. 630, Université Paris-Sud 91405 Orsay cedex.

Colletotrichum lindemuthianum est l'agent responsable de l'anthracnose sur le haricot commun, Phaseolus vulgaris. Ce champignon constitue un modèle intéressant car i) il présente un cycle infectieux hémibiotrophe avec une phase biotrophe bien définie, et ii) il développe au cours de son cycle sur la plante-hôte tous les types de structures d'infection spécialisées représentatives des structures développées par les champignons phytopathogènes: appressorium, vésicule d'infection, hyphes primaires et hyphes secondaires. Pour initier l'étude des différents stades de développement du cycle infectieux par une approche de type transcriptome, 5000 ADNc indépendants ont été archivés dont la moitié ont été déposés sur des membranes pour étudier l'expression des gènes correspondant. La mise au point d'une méthode de production in vitro d'appressoria qui sont les structures spécialisées dans la pénétration des tissus végétaux, nous a permis d'entamer la recherche de gènes présentant une expression spécifique durant la mise en place et/ou la fonctionnalité de ce type de structures. Des clones présentant une expression différentielle spécifique ont été identifiés et analysés. De façon similaire, nous avons identifié des clones présentant une expression différentielle entre des appressoria issus de la souche sauvage et des appressoria issus d'une souche mutante bloquée lors de la phase de pénétration. Le phénotype de cette souche mutante résulte de l'inactivation du gène clk1 qui code une Ser/Thr kinase, et les gènes identifiés constituent ainsi de bons candidats à être des cibles de la voie de transduction du signal dont fait partie la protéine CLK1.